Program Studi S1 ​​Matematika  secara resmi didirikan berdasarkan surat keputusan Dirjen Dikti No. 296 /DIKTI/Kep/2000, 25 Agustus 2000 sebagai salah satu program studi  di Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Halu Oleo.